曾經令人驚訝的是,基因上的化學標記可以影響它們的表達而不改變DNA序列的想法是教科書的內容。表觀遺傳學現象已經出現在信使RNA(mRNA)中,這種分子將遺傳信息從DNA傳遞到細胞的蛋白質制造工廠。在上個月的一次會議上,研究人員討論了RNA表觀遺傳學對基因表達和疾病至關重要的證據,他們描述了一種與白血病相關的新化學修飾。
研究發現,表觀遺傳標記裝飾了柵欄上的圣誕燈等mRNA。美國馬里蘭州貝塞斯達國家癌癥研究所(NCI)的RNA生物學家佩德羅巴蒂斯塔在會議上說,該細胞使用這些標記“確定應該在何時,何時以及產生多少[相關]蛋白質”。更重要的是,紐約市Memorial Sloan Kettering癌癥中心的邁克爾·卡拉斯說,mRNA修飾“可以影響細胞的活力,無論細胞分裂,癌癥,神經系統疾病。”它們為藥物開發者提供了有希望的線索。而且,他補充道,“這些東西可能很重要,有些人甚至都不看。”
在20世紀70年代報道了修飾的mRNAs,但是到2008年它們基本上被遺忘了。然后,芝加哥大學的川鶴,康奈爾大學的Samie Jaffrey和以色列特拉維夫大學的Gideon Rechavi重新煥然一新。他們的研究小組專注于一種名為m6A的mRNA修飾:甲基 - 一種簡單的化學單元 - 與一些RNA分子的腺嘌呤堿基相連。他的研究小組表明,一種眾所周知的酶可以消除這種mRNA的修飾,這表明m6A具有重要的生物學作用,而Jaffrey和Rechavi的研究小組開發的測繪工具顯示它很普遍。在研究之前,研究人員知道mRNA表觀遺傳標記存在,但“他們只是不知道如何真正尋找它們,”NCI研究員Shalini Oberdoerffer說。
mRNA的至少半打修改,米6A是最好的研究。當被稱為讀取物的蛋白質附著在其上時,它們指導著標記mRNA的命運 - 這可能會發生顯著變化。
例如,m6A促進胚胎干細胞正常分化成不同細胞類型所需的基因表達。但在血液干細胞中,m6A限制了分化。在走歪-m的血液干細胞的白血病的疾病6阿通過保持細胞在干細胞樣狀態維持的疾病。在2017年,三組,包括卡拉思的,獨立地表明消除放置米酶6甲mRNA上殺死急性髓細胞白血病的腫瘤細胞。至少有三家生物技術公司正在開發用于阻斷這些酶的實驗藥物。
在會議上,英國劍橋大學的Tony Kouzarides報道了一種新的mRNA修飾和一種驅動白血病的相關酶。他說,“我懷疑會有很多很多與白血病相關的聯系”。
事實證明,M6A在大腦中也是至關重要的。通過其讀者,它控制小鼠發育過程中新神經元形成的精確時間,并使神經元損傷后軸突再生。修改也增強了記憶力。當他的團隊在小鼠中敲除了一個m6A讀者的基因時,其他正常的動物都有記憶缺陷。注射攜帶正常閱讀基因的病毒可以逆轉這種效應。他們去年在“自然”雜志上報道說,當研究人員化學刺激神經元模仿新記憶的增加時,他們看到了一系列依賴于m6A的蛋白質合成。
幾年前,Oberdoerffer預感到細胞可能會在mRNA上使用另一種簡單的化學單元 - 乙?;?。她的團隊去年在Cell報道了許多mRNA胞嘧啶堿基被乙酰化。這種變化通過穩定分子來促進翻譯,也許還可以通過幫助mRNA與正確的轉移RNA(tRNA)相匹配,這些小RNA分子可以讀取mRNA并為不斷增長的蛋白質鏈添加氨基酸。當mRNA和tRNA相互補充時,它們結合,觸發氨基酸的添加。但系統并不精確 - 有更多可能的mRNA序列比tRNA更多,因此tRNA必須以某種方式找到(并結合)一些不匹配的mRNA。
Oberdoerffer的團隊發現了一個神秘的線索:乙?;膍RNA堿基通常位于tRNA必須識別mRNA的地方,盡管不匹配。研究人員發現,RNA修飾的存在極大地促進了基因翻譯。Oberdoerffer認為修飾不是正確mRNA-tRNA識別所必需的,但它可能會加強結合?!拔艺J為我們將了解到我們所知道的遺傳密碼不是一個靜態的實體,”她說與其他剛剛起步的研究領域一樣,RNA表觀遺傳學(也稱為表型轉換組學)也有其懷疑論者。2016年,一組在“自然”雜志上報道,它發現了一種新的修飾,m1A,超過7000個位點,跨越細胞的mRNA互補。但是一年后在同一期刊中,另一組聲稱最多存在15個mRNA m1A位點。“因此,分子生物學界的每個人對這些[mRNA]修飾的有效性都有點懷疑,”Jaffrey說。
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